Pohjois-Päijänteen kalatalousalueen toimivaltaan kuuluu (kalastuslain 24 §):
1) kalavarojen kestävän käytön ja hoidon suunnittelu;
2) käyttö- ja hoitosuunnitelmaehdotuksen laadinta, hyväksytyn suunnitelman toimeenpano ja sen vaikutusten seuranta;
3) kalavarojen käyttöön ja hoitoon liittyvä tiedotus;
4) kalastuksenvalvonnan järjestäminen;
5) kalastuksen sekä kalakantojen hoitotoimenpiteiden seurantatietojen kerääminen;
6) kalastuksen yhtenäislupa-alueiden muodostamisen edistäminen vapaa-ajan ja kaupallisen kalastuksen tarpeisiin;
7) vesialueen omistajien kalatalousalueelle siirtämät tehtävät;
8) viehekalastuksesta kertyneiden korvausvarojen jako vesialueen omistajille;
9) muut elinkeino-, liikenne- ja ympäristökeskuksen tulosohjaukseen sekä tähän lakiin perustuvat tehtävät.
Kalatalousalueella voi olla muutakin tehtäviä ja hankkeita, jotka hallitus tai yleiskokous on sille antanut.
Kalatalousalueen organisaatioon kuuluvat yleiskokous, hallitus ja toiminnanjohtaja.